Une nouvelle menace phytosanitaire sur la pomme de terre en Afrique de l’Est

Les scientifiques du CGIAR-IITA, en collaboration avec le Centre international de physiologie et d’écologie des insectes (icipe) sous l’unité conjointe de nématologie, NemAfrica, hébergé sur le campus de l’icipe à Nairobi, et leurs partenaires nationaux et internationaux, ont été à l’avant-garde des efforts faisant face à une nouvelle menace phytosanitaire émergente pour la production de pommes de terre dans la région de l’Afrique de l’Est et dans de nombreux autres pays du monde.

Ce sont les vers microscopiques parasites connus sous le nom de nématodes à kyste de la pomme de terre (PCN). Ces ravageurs destructeurs attaquent les racines de la pomme de terre et peuvent entraîner des pertes de rendement allant jusqu’à 80% et, dans certains cas, une perte totale de la récolte.

Le PCN se compose principalement de deux espèces, Globodera rostochiensis et Globodera pallida, qui ont récemment été découvertes en train d’attaquer la pomme de terre au Kenya. Cependant, G. rostochiensis s’est révélé répandu dans tout le Kenya et a également été détecté plus loin en Ouganda et au Rwanda.

«Les NPC sont parmi les ravageurs de la pomme de terre les plus destructeurs au monde. Ils sont particulièrement mortels parce que chaque nématode femelle produit des centaines d’œufs – entre 300 et 500, qui restent protégés dans un kyste formé par leur corps après leur mort. Ces kystes peuvent rester dormants dans le sol pendant des années, en attendant le prochain hôte de la culture de pommes de terre. En raison des dangers qu’ils présentent, les NPC ont été désignés comme organismes de quarantaine dans de nombreux pays, afin de contrôler strictement leur propagation », déclare Danny Coyne, nématologue et scientifique spécialisé dans la santé des sols à l’IITA.

Suite à la détection de G. rostochiensis au Kenya en 2015, les scientifiques de l’IITA en partenariat avec leurs homologues de l’icipe et de l’Université Jomo Kenyatta d’agriculture et de technologie (JKUAT), entre autres, ont mené une enquête à l’échelle nationale qui a révélé que G. rostochiensis n’était pas seulement répandu dans tout le pays, y compris dans les zones limitrophes de l’Ouganda et de la Tanzanie, mais aussi en très fortes concentrations.

Ces résultats ont été publiés dans l’article intitulé Potato Kyst Nematodes: A new menace to potato production in East Africa, publié en mai 2020 dans Frontiers in Plant Science.

L’équipe a également établi la présence du ravageur en Ouganda, et les résultats ont été publiés en tant que Premier rapport de nématodes à kystes de la pomme de terre Globodera rostochiensis (Wollenweber, 1923), infectant la pomme de terre (Solanum tuberosum L.) en Ouganda en juin 2020 dans Plant Disease. Des chercheurs rwandais ont également détecté ces nématodes dans le pays.

Les scientifiques de l’IITA et leurs partenaires sont également engagés dans une étude visant à explorer une approche innovante pour lutter efficacement contre ces ravageurs en utilisant une « éclosion de suicide ».

 L’éclosion des œufs de nématodes de leur kyste protecteur dans le sol, où ils trouvent ensuite les racines de la plante hôte, est déclenchée par des substances chimiques libérées par les racines de la pomme de terre. Les nématodes juvéniles nouvellement éclos utilisent ensuite d’autres signaux chimiques provenant des racines pour localiser et infecter les racines de pommes de terre.

L’identification de ces produits chimiques et leur production synthétique peuvent offrir des possibilités de manipuler les NPC pour qu’ils éclosent dans les champs des agriculteurs avant la plantation des pommes de terre, et en l’absence de l’hôte pour se nourrir, les nématodes mourront de faim – « éclosion de suicide».

Les résultats de l’étude ont été publiés dans l’article, Mediation of Potato – Potato Kyst Nematode, G. rostochiensis interaction by specific root exsudate components in Frontiers in Plant Science.

Les chercheurs de l’IITA travaillent également avec des partenaires, notamment le Kenya Plant Health Inspectorate Service (KEPHIS), James Hutton Institute au Royaume-Uni et le Centre international de la pomme de terre (CIP), entre autres, pour identifier des cultivars de pomme de terre appropriés résistants aux nématodes et aux attributs similaires aux variétés préférées des agriculteurs.

L’équipe redoublera d’efforts pour trouver une solution efficace à cette menace, qui peut sonner le glas de la pomme de terre et des revenus de millions de personnes dans la région.